@César: Son dos frutos completamente distintos.
El tomatillo (tomate verde) se usa mucho en la cocina mexicana para preparar guisados y salsas. A diferencia del jitomate (tomate rojo), no se come solo.
Si (al menos en el centro de México) pides un tomate, en vez del fruto rojo que esperas, te van a dar una cosa como ésta: