DRAE gives,
con todo, con todo eso, o con todo esto
1. locs. advs. No obstante, sin embargo.
http://dle.rae.es/?id=ZxVCoJq
Oxford gives these examples,
con todo y con eso / con todo — (bien mirado) all in all
More example sentences
con todo, sigo pensando que … — all the same / even so I still think that …
In your example,
Con todo, hay pros y contras.
I would say,
However, there are pros and cons.
Saludos cordiales.