También es posible, pero yo no utilizaba "civiles" como sustantivo, sino como adjetivo, que significa "perteneciente o relativo a la ciudad o sus ciudadanos". En español usamos mucho la palabra "civil" como adjetivo, por ejemplo:
Código Civil.
Derecho civil.
Arquitectura civil.
Desobediencia civil
Matrimonio civil.
etc.
El Código Civil, por ejemplo, es el código aplicado a los ciudadanos.
De todos modos, "de los civiles" también es correcto. Para evitar redundancia, se puede cambiar el segundo "de" por "sobre":
Las percepciones de los civiles sobre el oficial profesional.