En cuanto a la pregunta original, significan lo mismo, pero su uso puede ser un poco distinto. En mi opinión,
fuera se usa más que
fuese, y
fuese se oye un poco más poético, literario etc.
Tengo una pregunta para los hablantes nativos- ¿Cuál sería más usual?
Me dijo que entrara a las diez.
Me dijo que entrase a las diez.