The most common usage is the pronominal one. As indicated above.

But in DRAE on line, there is an intransitive definition that may or may not have the pronoun (me, te se, nos, os, se)
percatar
1. intr. Advertir, considerar, cuidar. U. t. c. prnl.
I had never used it in this sense, and never heard it or read it before. Yet I googled it and found some valid examples (although, this usage is not common at all in my experience.)
Examples found in googling it,
...al final de la sesión si no pudimos
percatar algo de la música que estaban poniendo para cerrar.
(In the sense of "advertir" as in "percibir".)
*No pude evitar
percatar algo así,
*En cualquier caso, nadie parece
percatar algo distinto en ti o en el ambiente, siguen en su mundo
*Miran cada rincón visible tratando de
percatar algo.
*Entre la multitud le pareció
percatar algo sumamente familiar,
*los hombres en nuestra gran mayoría hemos nacido sin la capacidad de poder
percatar la idea de romance femenino,
*Debemos
percatar la idea de que el mundo no es perfecto ya que hay muchos tropiezos los cuales debemos de aprender de ellos y superarlos.
I would personally use "percibir" instead, on the majority of the cases... But as you can see, there are some people using "percatar" without any pronominal particle. What can I say...